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  • Lectures recommandées

    LA COMPARAISON DE SEQUENCES

    1. Introduction
    2. Déduire par homologie
    3. Homologie et similitude
    4. Alignement de séquences
    5. Alignement local/global
    6. Prog. dynamique
    7. Matrices de substitution
    8. Matrices Dayoff & PAM
    9. Logiciels
    10. Statistiques de Blast

    BLAST EN PRATIQUE

    1. Blast
    2. Le serveur Blast
    3. Résultats de Blast
    4. Blastx cDNA / Prot
    5. Blastn cDNA / Gb
    6. Blastn cDNA / dbEST
    7. Pieges: vecteurs
    8. Pieges: basse complex.
    9. Séquences répétées
    10. Pièges: Alu
    11. Pièges: transmembrane
    12. Protéine ou ADN?

    ALIGNEMENT MULTIPLE

    1. Pourquoi?
    2. consensus
    3. Expression regulière
    4. Profils
    5. PSI-Blast
    6. Sortie PSI-Blast
    7. Clustal
    8. Formulaire ClustalW
    9. HMM
    10. Prosite
    11. Banques domaines

    PHYLOGENIE

    1. Phylogénie
    2. Arbres
    3. Arbres et homologie
    4. Algorithmes
    5. UPGMA
    6. NJ
    7. Le Bootstrap
    1. Analyse fonctionnelle in silico
    1. Travaux Pratiques DESS Bioinfo UPS
    2. TRAVAUX PRATIQUES GBMA 2 Tronc commun
    3. TRAVAUX PRATIQUES GBMA 2 Option Santé