Lectures recommandées

Génomes

Les articles de Nature sur le génome humain.L'article principal de 62 pages écrit par le consortium international de séquençage du génome humain est une synthèse essentielle des connaissances sur le sujet. Toutes les grandes questions sont abordées.
Genome sequence of the nematode C. elegans: A platform for investigating biology. The C. elegans sequencing consortium. Science, 282, 2012-2018. A quoi sert la séquence de C. elegans?
Science Life with 6000 genes Le génome de la levure

Algorithms on Strings, trees, and sequences. D. Gusfield. (1997) Cambridge University Press. La bioinformatique sous l'angle algorithmique
Biological Sequence Analysis. Probabilistic models of proteins and nucleic acids. (1998) R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison. Cambridge University Press. La bioinformatique sous l'angle des HMM
L'analyse des génomes. Cartographie, Séquencage et identification des gènes. A. Bernot. (1996) Nathan Université. Une introduction à la génomique facile à lire.
Bioinformatics : A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins (1998) Andreas Baxevanis (Editor), B.F.Francis Ouellette (Editor) John Wiley & Sons.
Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach (2000) by Pavel A. Pevzner. MIT Press.
Bioinformatics: Methods and Protocols (2000) Stephen Misener (Editor), Stephen A. Krawetz (Editor) Humana Press.

Trends Guide to Bioinformatics. TIBS, suppl. (1998) Articles de Boguski, Altschul, Brenner, Haussler, etc. Quelques lectures faciles (mais superficielles).
Predicting functions from protein sequences - where are the bottlenecks? (1998) Bork & Koonin, Nature Genetics, 18, 313-318. La référence en détermination de fonction par bioinformatique
Annotating eukaryote genomes (2000) Lewis et al. Curr. Op. Struct. Biol. 10:349-354. Un résumé des méthodes de détection de gènes, prok et euk.

Pour la Science. Dossier Hors Série "L'EVOLUTION", Janvier 1997. Un excellent numéro spécial, avec plusieurs articles sur la phylogénie moléculaire. Lire en particulier celui de Russ Doolitle et Peer Bork, p. 98.

Nature Genetics suppl. (vol. 21, Jan 1999) un excellent numéro spécial-puces, couvrant en détail toutes les applications et les problèmes de bioinformatique