Déduction par homologie
On estime que les nouveaux gènes apparaissent à partir de gènes existants, au moyen
de différents mécanismes:
- duplication (de gène, de région chromosomique, ou par polyploïdisation).
- réarrangements (insertion/délétion d'éléments)
- Mutation (facilitée par la présence de 2 copies)
66% des protéines de coli appartiennent à un groupe de protéines homologues
Un très grand nombre de fonctions sont déjà connues - Probablement
la plupart. On peut donc le plus souvent identifier la fonction d'un
nouveau gène par homologie.
Paralogues et orthologues (Fitsh, 1970)
- Paralogues: gènes homologues issus d'un phénomène de duplication
- Orthologues: gènes homologues issus d'un phénomène de spéciation
- Transfert horizontal: par endosymbiontes, etc. Fitsch a aussi introduit "xénologue"
pour évoquer ce cas.