Alignement multiple
Pourquoi faire de l'alignement multiple?
L'alignement multiple révèle des fonctions que l'on ne pouvait pas
visualiser en comparant 2 séquences
- Identifier les positions et les acides aminés importants.
- Visualiser les domaines
- Distinguer paralogues et orthologues
- Etablir la phylogénie des séquences, et même parfois
des organismes
- Comme une aide à la modelisation: Les algorithmes de
prediction de structures secondaires exploitent beaucoup mieux les
alignements multiples. Connaitre les aminoacides permis à telle
ou telle position facilite l'inférence 3D.