Retour sommaire général
BOINFORMATIQUE FONCTIONNELLE
- Introduction
- Déduction par homologie
- Qu'est-ce que l'homologie?
- Paralogues et orthologues
- Déduire par homologie
Alignement 2 à 2
- Protéine ou ADN?
- Blast
- Le serveur Blast
- Advanced Blast
- Blastx cDNA / Prot
- Blastn cDNA / Gb
- Blastn cDNA / dbEST
- Résultats de Blast
- Pieges: vecteurs
- Pieges: basse complex.
- Séquences répétées
- Pièges: Alu
- Pièges: transmembrane
- Matrices de substitution
- Fasta
Alignement multiple, domaines et motifs
- Pourquoi?
- Motifs et domaines
- Prosite
- Expression regulière
- Profils
- Banques domaines
- Clustal
- Formulaire ClustalW
- PSI-Blast
Conclusions
- Web vs Unix
- Unix pour la bioinfo
- Résumé: déterminer une fonction