Programme de recherche de gènes eucaryotes
GENSCAN
(Burge & Karlin, J. Mol. Biol. 268, 1-17, 1998.
Utilise les hmm. Plusieurs modèles sont employés pour exons, introns, promoteurs, etc.
Sensibilité et Spécificité autour de
80% pour les exons correctement prédits. Beaucoup moins bon pour
la prédiction de gènes complets.
GRAIL (Uberbacher & Mural,
PNAS, 88, 261-11, 1991).
Utilise les Réseaux
neuronaux. Moins performant que GENSCAN, mais reste connu comme
l'un des pionniers.