Le clonage positionnel

La stratégie classique d'identification d'un gène muté responsable d'une pathologie (maladie monogénique). Stratégie lente et chère. Identification du gène de la mucoviscidose (cystic fibrosis) par Tsui & Collins (1989).

• Prélèvements d'ADN sur des familles atteintes de la maladie.
• Analyse de liaison, à l'aide de 200 à 300 marqueurs répartis le long des chromosomes.
• Identification d'un intervalle (généralement plusieurs Mb)
• Utilisation de la carte physique pour déterminer les YAC à analyser
• Détermination de l'ensemble des gènes présents dans la région (par ex. utilisation des EST).
• Séquençage, identification des mutations/délétions etc. chez le patient (Attention au simple polymorphisme).

42 gènes identifiés en 1995. Plus difficilement applicable aux maladies multigéniques (cardiovasculaire, diabète, cancer, schizophrénie,...)

Il existe de nombreux types d'altérations. Par exemple, amplification de triplets: dans le syndrome dit "X-fragile", un triplet CGG qui se trouve en 10-20 exemplaires dans la partie 5' non traduite du gène, se retrouve en 50-100 copies.