Banques d'EST

gbEST / dbEST

• Inclus dans Genbank (nr comprend ESTs)
• 2.000.000 de séquences environ. 7 Gb de données avec les annotations (11-98).

Les index d'EST

• Unigene: banque d'ESTs classifiés ("clusterisés"). Dans chaque cluster Unigene sont regroupés des EST ayant une similarité de séquence significative. On peut donc trouver des transcripts différents et des artefacts (chimères, etc.). Unigene ne propose pas de mRNA reconstruits (contigs) à partir des séquences d'un cluster.
• TIGR Human Gene Index (HGI). Ici encore on a clusterisé les EST, mais HGI est une banque de "contigs", c.a.d. de séquences de mRNA reconstruites à partir des EST d'un même cluster. Les clusters étant souvent hétérogènes, ils produisent souvent plusieurs contigs. Ces contigs doivent théoriquement correspondre à des mRNA alternatifs.